В определенной мере АИН является правопреемницей Академии наук СССР в области прикладных наук, ориентированных на развитие промышленности, сельского хозяйства и оборону страны. АИН осуществляет свою деятельность почти на всей территории России от Калининграда до Владивостока и имеет в своем составе 10 межрегиональных отделений, более 50 региональных отделений в ведуших субъектах Российской Федерации, 17 научных отделений, 40 Территориальных научных центров (ТНЦ).